Poruchy termočlánkov sú jednou z hlavných príčin prestojov systému horúcich vtokov a bežné problémy majú zrejmé charakteristiky a príčiny. Najčastejšou poruchou je prerušený obvod, najmä v dôsledku pretrhnutia vnútorného zliatinového drôtu spôsobeného tepelnou cyklickou únavou, mechanickými vibráciami alebo nesprávnou inštaláciou a ohnutím. Časté zmeny teploty spôsobujú opakovanú expanziu a kontrakciu drôtu, čo v konečnom dôsledku vedie k prasknutiu, najmä v prípade termočlánkov nízkej kvality-.
Skrat je ďalším bežným problémom, zvyčajne spôsobený poškodením vnútornej izolačnej vrstvy. Infiltrácia roztaveného plastu, erózia vlhkosti alebo chemická korózia poškodia izoláciu oxidu horečnatého, čo spôsobí kontakt dvoch zliatinových drôtov a rušenie signálu. Rozšírený je aj posun teplôt spôsobený nečistými zliatinovými materiálmi, starnutím pri vysokej teplote alebo dlhodobým{3} používaním, čo vedie k nepresnému meraniu teploty a ovplyvňuje kvalitu výlisku.
Mechanické poškodenie, ako sú rozdrvené sondy, opotrebované káble alebo uvoľnené konektory, spôsobia prerušované prerušenie signálu a nestabilnú teplotu. Okrem toho elektromagnetické rušenie netienenými vodičmi alebo neprimeraným zapojením skreslí signál termočlánku, čo má za následok kolísanie teploty. Mnohým problémom sa dá predísť výberom-kvalitných produktov, štandardizáciou inštalácie a pravidelnou údržbou. Pochopenie týchto bežných problémov pomáha používateľom rýchlo diagnostikovať chyby a znižovať výrobné straty.
